15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1149 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  357  4e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  53.37 
 
 
159 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  66.39 
 
 
160 aa  174  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  59.29 
 
 
160 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  55.22 
 
 
154 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  56.56 
 
 
148 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  55.65 
 
 
150 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  42.06 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  39.5 
 
 
148 aa  91.3  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  84.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  41.38 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  39.8 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  33.59 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  30.68 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>