295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1028 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  69.59 
 
 
502 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
502 aa  1045    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  77.46 
 
 
497 aa  827    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  69.46 
 
 
508 aa  754    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  71.51 
 
 
502 aa  776    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.85 
 
 
462 aa  273  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.32 
 
 
283 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  42.66 
 
 
299 aa  238  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.79 
 
 
285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.88 
 
 
286 aa  233  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  41.11 
 
 
281 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.81 
 
 
284 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.32 
 
 
295 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.32 
 
 
295 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.38 
 
 
293 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.71 
 
 
294 aa  210  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  39.25 
 
 
349 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.41 
 
 
334 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  40.41 
 
 
296 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.48 
 
 
296 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 
317 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.3 
 
 
292 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.31 
 
 
317 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  39.37 
 
 
299 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.66 
 
 
326 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  37.24 
 
 
281 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.97 
 
 
306 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  39.55 
 
 
308 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.08 
 
 
300 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.08 
 
 
300 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  40.75 
 
 
290 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.81 
 
 
288 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.05 
 
 
295 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.52 
 
 
302 aa  172  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.89 
 
 
281 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.3 
 
 
294 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  33.1 
 
 
296 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.22 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  32.53 
 
 
297 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
305 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.77 
 
 
305 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.77 
 
 
296 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.56 
 
 
290 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.31 
 
 
320 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.22 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  29.62 
 
 
290 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.64 
 
 
290 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  32.98 
 
 
285 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  32.98 
 
 
285 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.95 
 
 
294 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.19 
 
 
295 aa  150  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.47 
 
 
303 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.3 
 
 
303 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  31.94 
 
 
303 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  30.3 
 
 
303 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  31.54 
 
 
296 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  30.72 
 
 
301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  46.32 
 
 
193 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  31.85 
 
 
285 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.68 
 
 
189 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.35 
 
 
282 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  29.05 
 
 
301 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.39 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.56 
 
 
302 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  34.43 
 
 
213 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.04 
 
 
276 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  34.43 
 
 
213 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.94 
 
 
187 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.87 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  35.98 
 
 
186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  35.98 
 
 
186 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.41 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.27 
 
 
304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.21 
 
 
291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  37.5 
 
 
204 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  37.91 
 
 
194 aa  127  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.15 
 
 
297 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.43 
 
 
282 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  37.25 
 
 
194 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  32.78 
 
 
194 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  38.1 
 
 
185 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  32.96 
 
 
188 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  35.95 
 
 
182 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.72 
 
 
282 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  32.95 
 
 
216 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  29.08 
 
 
282 aa  120  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  29.03 
 
 
282 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.24 
 
 
282 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  35.76 
 
 
184 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35.06 
 
 
192 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35.06 
 
 
192 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.51 
 
 
211 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  28.93 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  28.33 
 
 
295 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  32.61 
 
 
193 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  27.68 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.96 
 
 
190 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.34 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.93 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>