120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3525 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  53.82 
 
 
294 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  57.14 
 
 
334 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  56.79 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  55.59 
 
 
300 aa  325  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  55.59 
 
 
300 aa  325  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  53.79 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.82 
 
 
306 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.6 
 
 
295 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.13 
 
 
296 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.25 
 
 
295 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  43.46 
 
 
296 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  41.99 
 
 
299 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.66 
 
 
292 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.04 
 
 
286 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.75 
 
 
284 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.45 
 
 
285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.07 
 
 
317 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.07 
 
 
317 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.53 
 
 
283 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  41.3 
 
 
502 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.25 
 
 
462 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  40.71 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.51 
 
 
497 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.72 
 
 
300 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.51 
 
 
294 aa  208  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.04 
 
 
293 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  39.55 
 
 
502 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.99 
 
 
508 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.62 
 
 
294 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  38.63 
 
 
281 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  36.75 
 
 
349 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.41 
 
 
502 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.93 
 
 
290 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.64 
 
 
288 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.87 
 
 
302 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.83 
 
 
296 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.15 
 
 
295 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.78 
 
 
305 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.93 
 
 
290 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  34.14 
 
 
303 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  35.11 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  35.15 
 
 
296 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.84 
 
 
281 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.5 
 
 
295 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  39.35 
 
 
290 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  34.26 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  34.38 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.75 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.53 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.04 
 
 
291 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.75 
 
 
303 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  32.75 
 
 
303 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  34.62 
 
 
297 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.71 
 
 
302 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.36 
 
 
306 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.79 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.87 
 
 
301 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
297 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  32.73 
 
 
285 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  31.88 
 
 
285 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.87 
 
 
297 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.99 
 
 
297 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  32.61 
 
 
285 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  32.64 
 
 
293 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.96 
 
 
282 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.64 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.45 
 
 
296 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.88 
 
 
307 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  29.18 
 
 
282 aa  149  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.89 
 
 
282 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.86 
 
 
276 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  30.6 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  32.16 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.9 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  33.1 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  29.79 
 
 
295 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  29.18 
 
 
282 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.23 
 
 
293 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.85 
 
 
282 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.28 
 
 
300 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.88 
 
 
293 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  30.88 
 
 
293 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  30.88 
 
 
293 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  33.1 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.83 
 
 
282 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.38 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.49 
 
 
320 aa  136  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  29.21 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  29.86 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  31.34 
 
 
296 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.21 
 
 
299 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.86 
 
 
300 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  30.14 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.42 
 
 
297 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.86 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.9 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  24.62 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  25.63 
 
 
730 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>