106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2316 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  60.34 
 
 
294 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  57.93 
 
 
299 aa  346  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  58.54 
 
 
334 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  58.06 
 
 
326 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  55.59 
 
 
308 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  51.06 
 
 
306 aa  309  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.81 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.44 
 
 
292 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  41.7 
 
 
299 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.3 
 
 
295 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.3 
 
 
295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.25 
 
 
296 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  42.61 
 
 
296 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.07 
 
 
284 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  41.7 
 
 
281 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.96 
 
 
283 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.41 
 
 
317 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.41 
 
 
317 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.62 
 
 
286 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  39.36 
 
 
281 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  40.28 
 
 
502 aa  215  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.08 
 
 
462 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.65 
 
 
290 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.22 
 
 
300 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.8 
 
 
508 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.02 
 
 
296 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.03 
 
 
305 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.85 
 
 
294 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.33 
 
 
288 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.59 
 
 
502 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.24 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  40.15 
 
 
502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.18 
 
 
294 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.4 
 
 
293 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  36.46 
 
 
349 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.09 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.3 
 
 
281 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.46 
 
 
303 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  35.46 
 
 
303 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.89 
 
 
290 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.68 
 
 
295 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  39.18 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.27 
 
 
295 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.76 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.86 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  34.39 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  36.3 
 
 
301 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  33.09 
 
 
290 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.49 
 
 
302 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.34 
 
 
303 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  34.47 
 
 
296 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.69 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.31 
 
 
301 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  34.25 
 
 
301 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  35.64 
 
 
285 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  32.86 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.57 
 
 
282 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.24 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.79 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  34.55 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  34.55 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.25 
 
 
297 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  32.86 
 
 
282 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.46 
 
 
276 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.54 
 
 
282 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.5 
 
 
282 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  32.14 
 
 
282 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.92 
 
 
297 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  32.67 
 
 
303 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  32.77 
 
 
296 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
293 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  30.39 
 
 
295 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.72 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.72 
 
 
293 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  31.72 
 
 
293 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.08 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.79 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.49 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  32.98 
 
 
282 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.56 
 
 
304 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  32.14 
 
 
293 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  32.42 
 
 
296 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.02 
 
 
307 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
278 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.82 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.03 
 
 
296 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.03 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.67 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.64 
 
 
300 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.27 
 
 
300 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.66 
 
 
297 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  27.24 
 
 
300 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.46 
 
 
299 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.9 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  31.4 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.89 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  21.75 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.53 
 
 
722 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>