More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3431 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  33.71 
 
 
2561 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.65 
 
 
3470 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.98 
 
 
4342 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 
3291 aa  780    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.28 
 
 
4317 aa  732    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.31 
 
 
5953 aa  820    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.23 
 
 
6889 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  38.2 
 
 
4090 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.74 
 
 
4336 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.19 
 
 
6081 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.14 
 
 
2156 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.84 
 
 
2151 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 
1870 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.56 
 
 
2138 aa  674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.6 
 
 
3432 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.07 
 
 
4531 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.74 
 
 
6403 aa  786    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  37.75 
 
 
1872 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  36.5 
 
 
2125 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.57 
 
 
7168 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  35.11 
 
 
2137 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  32.34 
 
 
1569 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
3453 aa  656    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.16 
 
 
4336 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.35 
 
 
2154 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.13 
 
 
5596 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.42 
 
 
2581 aa  824    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.12 
 
 
9498 aa  789    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.12 
 
 
8211 aa  718    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.97 
 
 
13537 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.29 
 
 
6676 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.77 
 
 
4317 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 
4968 aa  780    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.53 
 
 
3308 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.63 
 
 
3498 aa  857    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 
3639 aa  722    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.21 
 
 
4991 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.35 
 
 
2370 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.89 
 
 
4960 aa  775    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  34.57 
 
 
2201 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.91 
 
 
6072 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  34 
 
 
4747 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.58 
 
 
4502 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.82 
 
 
4196 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 
3086 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.89 
 
 
4882 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  36.54 
 
 
2365 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.32 
 
 
4332 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 
2571 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  36.27 
 
 
2614 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  37.06 
 
 
2106 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  33.62 
 
 
1689 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  28.78 
 
 
1568 aa  700    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 
2193 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.21 
 
 
8646 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  37.28 
 
 
4290 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  37.14 
 
 
4489 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.31 
 
 
5738 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  39.11 
 
 
6661 aa  812    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  30.61 
 
 
1870 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
1550 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.35 
 
 
4317 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.26 
 
 
4318 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.22 
 
 
2156 aa  660    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.62 
 
 
4317 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.3 
 
 
4478 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.36 
 
 
4342 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  35.51 
 
 
2189 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  35.49 
 
 
2448 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  36.27 
 
 
2573 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.91 
 
 
4960 aa  779    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  30.96 
 
 
2156 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  34.85 
 
 
5213 aa  678    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.98 
 
 
7785 aa  693    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 
5230 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  31.31 
 
 
7122 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.87 
 
 
7310 aa  698    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 
3086 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1813 aa  3521    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 
2571 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 
5328 aa  776    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.16 
 
 
8914 aa  788    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 
5620 aa  629  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.86 
 
 
3695 aa  629  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  38.88 
 
 
1114 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  34.54 
 
 
3223 aa  626  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.39 
 
 
2791 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  34.55 
 
 
4572 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  36.67 
 
 
4106 aa  622  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.55 
 
 
7541 aa  622  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  33.73 
 
 
3102 aa  623  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  35.38 
 
 
5149 aa  622  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.94 
 
 
2386 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 
1693 aa  618  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  34.45 
 
 
4468 aa  620  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  36.59 
 
 
2403 aa  618  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.63 
 
 
5654 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.75 
 
 
3328 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 
3331 aa  615  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.75 
 
 
3352 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>