12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0876 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  100 
 
 
704 aa  1392    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  33.47 
 
 
539 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  28.72 
 
 
712 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  45.09 
 
 
523 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  29.98 
 
 
490 aa  164  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  25.03 
 
 
776 aa  163  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  41.44 
 
 
814 aa  144  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  25.43 
 
 
603 aa  134  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  45.16 
 
 
125 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  29.58 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  24 
 
 
310 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  36.67 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>