More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1011 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  99.74 
 
 
385 aa  789    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  790    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  72.66 
 
 
383 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  62.24 
 
 
390 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.11 
 
 
387 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.59 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 
390 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.03 
 
 
387 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
387 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.17 
 
 
387 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 
387 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 
387 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.99 
 
 
387 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 
387 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  57.07 
 
 
390 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  56.81 
 
 
390 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  55.76 
 
 
390 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
387 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  54.81 
 
 
389 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.5 
 
 
393 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  54.43 
 
 
388 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  53.26 
 
 
381 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.08 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
393 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
382 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 
382 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  53.12 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  53.12 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.41 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  53.12 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.65 
 
 
637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.56 
 
 
387 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
382 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.53 
 
 
402 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.78 
 
 
383 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.32 
 
 
383 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
382 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
382 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  50.53 
 
 
382 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 
382 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  51.32 
 
 
382 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.49 
 
 
382 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
382 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
383 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
382 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 
399 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 
382 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 
382 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
382 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 
384 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 
382 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.53 
 
 
382 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
389 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
383 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
383 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.74 
 
 
382 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
383 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  50 
 
 
382 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  52.13 
 
 
382 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  51.83 
 
 
382 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.58 
 
 
382 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  49.47 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
383 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
383 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  48.31 
 
 
383 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 
382 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
383 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
383 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 
383 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.72 
 
 
383 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.44 
 
 
358 aa  339  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.68 
 
 
383 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
382 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
390 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 
388 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  43.73 
 
 
382 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.73 
 
 
383 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.73 
 
 
383 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.73 
 
 
382 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.73 
 
 
382 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.73 
 
 
383 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.47 
 
 
383 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  43.47 
 
 
383 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 
388 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.47 
 
 
382 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>