More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0645 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
858 aa  673  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2983  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
877 aa  685  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.957955  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
944 aa  672  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07605e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
860 aa  689  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
857 aa  689  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
835 aa  766  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2588  leucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
864 aa  672  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224639  hitchhiker  2.06331e-09 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
879 aa  662  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
857 aa  675  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0575  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
864 aa  636  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.932947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0254  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
890 aa  660  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
879 aa  664  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0621  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
864 aa  642  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
859 aa  726  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
861 aa  667  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
868 aa  696  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
860 aa  688  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
880 aa  649  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
826 aa  840  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
821 aa  707  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
860 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
860 aa  688  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
824 aa  807  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
832 aa  759  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
867 aa  685  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
860 aa  690  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
860 aa  688  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
860 aa  688  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2912  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
880 aa  650  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
807 aa  669  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
806 aa  660  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
806 aa  669  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
825 aa  803  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
805 aa  659  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
607 aa  639  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
824 aa  880  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
860 aa  689  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0074  leucyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
821 aa  638  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
860 aa  686  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
860 aa  685  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
862 aa  712  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
904 aa  741  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
820 aa  708  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
894 aa  640  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
870 aa  661  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
819 aa  860  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
821 aa  647  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0473  leucyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
813 aa  654  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
860 aa  696  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0632  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
809 aa  642  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
838 aa  754  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
802 aa  780  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
874 aa  704  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 
863 aa  711  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60913e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
860 aa  703  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
860 aa  695  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
826 aa  811  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
868 aa  706  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  69.04 
 
 
816 aa  1175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
802 aa  785  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
860 aa  695  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
820 aa  707  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2732  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
864 aa  644  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0200142  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
828 aa  837  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6003  leucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
911 aa  660  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
807 aa  649  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
874 aa  700  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
872 aa  697  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
814 aa  847  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
865 aa  739  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
868 aa  716  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3443  leucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
855 aa  681  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
859 aa  775  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
854 aa  696  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
818 aa  711  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
860 aa  685  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
805 aa  800  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
824 aa  872  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 
831 aa  808  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
828 aa  820  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
801 aa  847  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
859 aa  761  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
857 aa  764  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.49617e-06  hitchhiker  1.03499e-06 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
829 aa  845  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
800 aa  755  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
861 aa  773  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
852 aa  756  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
856 aa  764  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
889 aa  636  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
857 aa  709  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
906 aa  643  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
875 aa  783  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3332  leucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
831 aa  720  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
820 aa  739  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
853 aa  765  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
936 aa  650  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
875 aa  774  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
863 aa  703  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
882 aa  637  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
819 aa  780  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>