More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2460 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  789    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  98.98 
 
 
392 aa  782    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  69.31 
 
 
394 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 
393 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  68.29 
 
 
393 aa  534  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
392 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
392 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  67.09 
 
 
393 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 
393 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  64.54 
 
 
392 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 
392 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  64.54 
 
 
392 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
393 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
393 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  65.82 
 
 
393 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  65.98 
 
 
391 aa  527  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
393 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
393 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
393 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
393 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
393 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  64.8 
 
 
393 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 
392 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
392 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 
393 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 
393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 
393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 
392 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
393 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.75 
 
 
396 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
393 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
393 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  63.27 
 
 
392 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.74 
 
 
396 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
393 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  62.92 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  65.82 
 
 
392 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  64.71 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  65.56 
 
 
393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  65.82 
 
 
393 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 
392 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 
395 aa  503  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  65.82 
 
 
393 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  65.31 
 
 
393 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
392 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
390 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
392 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
391 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 
392 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
392 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 
393 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
392 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  64.03 
 
 
390 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
391 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  63.08 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  63.59 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 
392 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
392 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 
394 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 
388 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  63.17 
 
 
398 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 
392 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  64.19 
 
 
394 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
391 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  64.03 
 
 
395 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 
394 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 
394 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
392 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
392 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 
392 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 
394 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
392 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 
394 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
391 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 
393 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 
394 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  61.89 
 
 
391 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
390 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  61.6 
 
 
408 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 
392 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 
391 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 
391 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 
391 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>