12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1275 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  100 
 
 
424 aa  848    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  75 
 
 
440 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  71.62 
 
 
431 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  44.71 
 
 
425 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  44.93 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  37.75 
 
 
406 aa  206  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  37.84 
 
 
406 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  36.34 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  35.28 
 
 
414 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  32.89 
 
 
420 aa  146  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  32.95 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  31.48 
 
 
421 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>