29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1993 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  88.78 
 
 
205 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  75 
 
 
205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  74.51 
 
 
205 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  74.51 
 
 
205 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  71.57 
 
 
205 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  72.06 
 
 
248 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  72.2 
 
 
206 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  72.2 
 
 
206 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  72.2 
 
 
206 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  72.5 
 
 
201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  70.24 
 
 
206 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  71.36 
 
 
222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  72.88 
 
 
179 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  70.79 
 
 
180 aa  267  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  64.17 
 
 
192 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  65.43 
 
 
192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  48.72 
 
 
198 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  40.12 
 
 
346 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  35.95 
 
 
310 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  35.29 
 
 
345 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  30.05 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  32.89 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  30.32 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  33.11 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  25.52 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  33.99 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>