More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4780 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  45.76 
 
 
306 aa  262  5e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  44.73 
 
 
307 aa  242  4e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  43.73 
 
 
357 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  40 
 
 
331 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  39.4 
 
 
298 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  40.07 
 
 
304 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  42.75 
 
 
302 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  42.75 
 
 
300 aa  216  3e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  42.75 
 
 
300 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  42.75 
 
 
300 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  42.75 
 
 
300 aa  215  6e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  42.38 
 
 
306 aa  212  8e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  42.38 
 
 
306 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  36.08 
 
 
327 aa  201  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  36.08 
 
 
327 aa  201  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
319 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.65066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
319 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.53945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  35.09 
 
 
311 aa  153  3e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
309 aa  147  2e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  34.86 
 
 
308 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  29.51 
 
 
316 aa  131  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  30.48 
 
 
313 aa  128  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  29.41 
 
 
324 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.24 
 
 
324 aa  121  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.9 
 
 
324 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.9 
 
 
324 aa  119  5e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.18711e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.9 
 
 
324 aa  119  5e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.9 
 
 
324 aa  119  5e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.9 
 
 
324 aa  119  5e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  30.98 
 
 
336 aa  115  1e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.26 
 
 
662 aa  114  1e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.44 
 
 
321 aa  114  2e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.08 
 
 
321 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.8 
 
 
321 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  26.8 
 
 
324 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  27.44 
 
 
322 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.8 
 
 
321 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  31.16 
 
 
309 aa  113  4e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
313 aa  112  8e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.44 
 
 
321 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.24 
 
 
322 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  27.44 
 
 
321 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  27.44 
 
 
321 aa  111  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.71 
 
 
322 aa  111  1e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26 
 
 
324 aa  110  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.52 
 
 
320 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  32.16 
 
 
340 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.52 
 
 
320 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.52 
 
 
320 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  32.25 
 
 
316 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  26.52 
 
 
320 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  28.75 
 
 
341 aa  108  8e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  29.66 
 
 
300 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  26.76 
 
 
305 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  26.04 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.16 
 
 
320 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.41 
 
 
320 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25.27 
 
 
320 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  26.35 
 
 
320 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  31.51 
 
 
312 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
300 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  26.57 
 
 
346 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  25.72 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  30.95 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
345 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
329 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  26.64 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.51 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
331 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  27.01 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
352 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.77 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.55327e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.77 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  25.55 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  25.58 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  25.55 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  27.14 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  30 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  27.74 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25.77 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.1 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.1 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.45758e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.1 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.12566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.1 
 
 
314 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
353 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
353 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
353 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.1 
 
 
314 aa  85.5  1e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.76883e-13  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>