19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0043 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  247  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  49.02 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  50.34 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  52.87 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  44.07 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  49.07 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  47.25 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  65.12 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  38.78 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  39.76 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  39.76 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  37.63 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1133  hypothetical protein  33.01 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.132897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>