41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2462 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  100 
 
 
429 aa  859    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  86.71 
 
 
411 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  92.38 
 
 
430 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  78.32 
 
 
427 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  77.96 
 
 
429 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  77.96 
 
 
429 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  77.6 
 
 
429 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  77.06 
 
 
427 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  77.7 
 
 
435 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  78.19 
 
 
421 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  77.21 
 
 
418 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  77.21 
 
 
418 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  77.21 
 
 
418 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  77.21 
 
 
418 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  75.29 
 
 
431 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  76.62 
 
 
423 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  76.16 
 
 
423 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  76.62 
 
 
423 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  44.54 
 
 
439 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  47.07 
 
 
442 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  45.83 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  45.21 
 
 
404 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  45.52 
 
 
404 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  36.43 
 
 
380 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  36.43 
 
 
380 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  35.73 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  32.41 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  43.33 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  35.55 
 
 
374 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  41.69 
 
 
350 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  34.97 
 
 
448 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  40.74 
 
 
354 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  38.46 
 
 
365 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  40 
 
 
370 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  29 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  33.01 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  34.05 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  33.09 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  32.1 
 
 
389 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  30.55 
 
 
441 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  25.16 
 
 
438 aa  96.3  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>