16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2002 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2002  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000203794  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0558  hypothetical protein  61.89 
 
 
381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000345423  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1164  hypothetical protein  52.99 
 
 
351 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10212  hitchhiker  0.00223915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6599  hypothetical protein  43.36 
 
 
355 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000567082  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0946  hypothetical protein  45.86 
 
 
351 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3238  hypothetical protein  44 
 
 
353 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0332747  hitchhiker  0.000366296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2871  hypothetical protein  39.09 
 
 
351 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3658  hypothetical protein  35.94 
 
 
502 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2298  hypothetical protein  33.9 
 
 
503 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0826  hypothetical protein  23.76 
 
 
497 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0391252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1523  hypothetical protein  21.31 
 
 
497 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00190948 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0146  hypothetical protein  23.58 
 
 
497 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
508 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235787  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0725  acetyltransferase  25.84 
 
 
511 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0717  acetyltransferase  25.07 
 
 
522 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0088  hypothetical protein  24.5 
 
 
525 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>