More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0845 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  42.36 
 
 
3470 aa  781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  41.21 
 
 
2664 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  39.11 
 
 
2174 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  41.48 
 
 
4317 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  41.12 
 
 
5953 aa  730    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.54 
 
 
6889 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  40.77 
 
 
2137 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41 
 
 
4336 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  41.58 
 
 
1104 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  42.34 
 
 
2845 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  44.26 
 
 
2151 aa  852    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  41.31 
 
 
6661 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  38.18 
 
 
2439 aa  658    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  37.22 
 
 
1816 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.43 
 
 
3432 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  40.66 
 
 
4531 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  40.46 
 
 
4317 aa  736    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  41.8 
 
 
1114 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  40.47 
 
 
4968 aa  764    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  37.02 
 
 
3374 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  38.5 
 
 
2350 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  39.84 
 
 
3021 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.32 
 
 
1789 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  41.45 
 
 
4336 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  41.29 
 
 
1136 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 
1569 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  44.28 
 
 
2154 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  45.18 
 
 
4991 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  37.81 
 
 
5926 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.03 
 
 
9498 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  39.26 
 
 
3639 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.99 
 
 
13537 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.87 
 
 
6676 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.14 
 
 
4383 aa  712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  42.11 
 
 
2867 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  35.75 
 
 
2791 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.87 
 
 
1142 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  42.21 
 
 
3308 aa  812    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  40.9 
 
 
3498 aa  784    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  41.67 
 
 
2033 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.1 
 
 
2370 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.35 
 
 
1786 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 
1137 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.9 
 
 
1436 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  41.11 
 
 
4317 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.77 
 
 
6072 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  36.85 
 
 
4572 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.69 
 
 
3291 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  43 
 
 
5654 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  42.94 
 
 
4502 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  38.6 
 
 
1383 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  39.91 
 
 
4882 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  40.22 
 
 
3002 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  37.65 
 
 
1369 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.3 
 
 
4332 aa  794    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.19 
 
 
8914 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  43.84 
 
 
3942 aa  821    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  44.24 
 
 
4037 aa  797    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  42.42 
 
 
1138 aa  794    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  40.58 
 
 
1801 aa  776    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  39.2 
 
 
2156 aa  748    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  39.91 
 
 
2125 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  45.17 
 
 
4136 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1119 aa  2279    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 
8915 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  38.58 
 
 
3231 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.24 
 
 
8646 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  41.45 
 
 
4342 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  40.09 
 
 
3291 aa  745    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  42.86 
 
 
3331 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  39.59 
 
 
5467 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.78 
 
 
2419 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.53 
 
 
1331 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  41.48 
 
 
4317 aa  745    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  39.36 
 
 
3176 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  41.44 
 
 
6176 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  41.18 
 
 
4342 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  45.37 
 
 
5149 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  41.76 
 
 
2189 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  44.67 
 
 
2448 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  40.37 
 
 
5596 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.74 
 
 
1129 aa  734    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  38.02 
 
 
1405 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  40.64 
 
 
2651 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  36.74 
 
 
1130 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  43.44 
 
 
3404 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  39.64 
 
 
4960 aa  763    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  39.09 
 
 
2156 aa  747    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  40.55 
 
 
2571 aa  751    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 
1833 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  40.98 
 
 
2155 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  36.36 
 
 
6006 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  40.54 
 
 
1556 aa  781    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  37.78 
 
 
6081 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  37.23 
 
 
4468 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  36.41 
 
 
3348 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  39.19 
 
 
3086 aa  754    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  41.04 
 
 
5230 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  38.01 
 
 
1127 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  42.47 
 
 
3432 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>