More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0845 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  36.54 
 
 
4196 aa  675  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  43.67 
 
 
5328 aa  775  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  39.49 
 
 
1550 aa  754  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  37.04 
 
 
2164 aa  701  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  40.23 
 
 
2997 aa  660  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  39.68 
 
 
2581 aa  707  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  41.2 
 
 
1578 aa  726  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  39.59 
 
 
5467 aa  677  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  41.21 
 
 
2395 aa  722  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  37.98 
 
 
1193 aa  666  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.1 
 
 
2370 aa  724  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.14 
 
 
4383 aa  712  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.24 
 
 
8646 aa  721  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  41.48 
 
 
4317 aa  745  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  41.04 
 
 
5230 aa  719  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.74 
 
 
1129 aa  734  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  42.47 
 
 
3432 aa  776  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  39.18 
 
 
4960 aa  754  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  39.87 
 
 
2156 aa  762  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  39.36 
 
 
3176 aa  700  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  36.95 
 
 
3235 aa  718  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  41.18 
 
 
4342 aa  762  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  45.37 
 
 
5149 aa  820  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  41.76 
 
 
2189 aa  768  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  44.67 
 
 
2448 aa  834  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  37.69 
 
 
2006 aa  721  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  36.68 
 
 
2193 aa  699  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  40.64 
 
 
2651 aa  671  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  36.74 
 
 
1130 aa  643  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 
1833 aa  666  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  36.36 
 
 
6006 aa  640  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  37.78 
 
 
6081 aa  665  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  37.23 
 
 
4468 aa  653  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  36.41 
 
 
3348 aa  650  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  37.2 
 
 
2054 aa  719  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  38.02 
 
 
1405 aa  648  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  41.21 
 
 
2664 aa  723  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.19 
 
 
8914 aa  702  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  39.09 
 
 
2156 aa  747  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  42.34 
 
 
2845 aa  766  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  40.77 
 
 
2137 aa  723  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.78 
 
 
2419 aa  662  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  40.98 
 
 
2155 aa  730  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  40.37 
 
 
5596 aa  682  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  41.8 
 
 
1114 aa  791  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 
1569 aa  692  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  38.01 
 
 
1127 aa  685  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  37.22 
 
 
1816 aa  688  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  41.31 
 
 
6661 aa  758  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  41.44 
 
 
6176 aa  719  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  42.86 
 
 
3331 aa  776  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.32 
 
 
1789 aa  697  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  43.84 
 
 
3942 aa  821  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  40.46 
 
 
4317 aa  736  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  43.44 
 
 
3404 aa  785  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  41.11 
 
 
4317 aa  762  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 
8915 aa  680  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  39.19 
 
 
3086 aa  754  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  40.54 
 
 
1556 aa  781  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  41.45 
 
 
4342 aa  761  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  45.17 
 
 
4136 aa  820  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  45.18 
 
 
4991 aa  800  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  40.55 
 
 
2571 aa  751  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  39.64 
 
 
4960 aa  763  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  39.2 
 
 
2156 aa  748  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  37.02 
 
 
3374 aa  645  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  38.5 
 
 
2350 aa  649  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  39.91 
 
 
2125 aa  679  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1119 aa  2279  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 
1137 aa  654  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  39.26 
 
 
3639 aa  699  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  38.18 
 
 
2439 aa  658  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  40.47 
 
 
4968 aa  764  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  42.36 
 
 
3470 aa  781  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  44.28 
 
 
2154 aa  827  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  37.81 
 
 
5926 aa  648  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.03 
 
 
9498 aa  655  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.99 
 
 
13537 aa  683  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.87 
 
 
6676 aa  733  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  40.91 
 
 
1556 aa  786  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  42.11 
 
 
2867 aa  775  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  35.75 
 
 
2791 aa  642  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.87 
 
 
1142 aa  704  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  42.21 
 
 
3308 aa  812  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  40.9 
 
 
3498 aa  784  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  41.67 
 
 
2033 aa  780  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  39.29 
 
 
3086 aa  754  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.35 
 
 
1786 aa  651  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.9 
 
 
1436 aa  671  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.77 
 
 
6072 aa  659  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  37.98 
 
 
1193 aa  666  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  41.29 
 
 
1136 aa  692  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.4 
 
 
1839 aa  646  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  39.11 
 
 
2174 aa  690  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  41.48 
 
 
4317 aa  746  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  41.12 
 
 
5953 aa  730  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.54 
 
 
6889 aa  751  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41 
 
 
4336 aa  776  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  41.58 
 
 
1104 aa  697  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  44.26 
 
 
2151 aa  852  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>