33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  32.22 
 
 
675 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  33.92 
 
 
644 aa  197  5e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  30.03 
 
 
603 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  31.26 
 
 
651 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30.95 
 
 
651 aa  188  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  31.02 
 
 
618 aa  184  5e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  32.36 
 
 
584 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  32.32 
 
 
692 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  30.09 
 
 
654 aa  174  3e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  27.33 
 
 
624 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  29.39 
 
 
659 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.12 
 
 
867 aa  168  3e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  32.67 
 
 
638 aa  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  28.39 
 
 
673 aa  164  5e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  37.24 
 
 
770 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  23.94 
 
 
633 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  36.84 
 
 
619 aa  136  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
623 aa  132  2e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  25.67 
 
 
615 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
616 aa  114  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  24.81 
 
 
593 aa  95.5  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  26.92 
 
 
624 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  24.92 
 
 
551 aa  86.7  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  23.82 
 
 
580 aa  85.1  3e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  27.49 
 
 
580 aa  80.5  9e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  36.04 
 
 
473 aa  75.5  3e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  28.62 
 
 
742 aa  72.4  2e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  34.36 
 
 
474 aa  68.2  4e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  32.64 
 
 
465 aa  64.7  5e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  27.25 
 
 
483 aa  53.5  1e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.69 
 
 
1072 aa  51.6  4e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
455 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>