More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  74.48 
 
 
514 aa  739    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  73.74 
 
 
517 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  68.15 
 
 
512 aa  683    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  74.64 
 
 
513 aa  757    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  68.49 
 
 
518 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  64.18 
 
 
511 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
484 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  65.3 
 
 
512 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  67.9 
 
 
526 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  68.24 
 
 
534 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  72.73 
 
 
515 aa  739    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  69.69 
 
 
502 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
496 aa  1009    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  65.48 
 
 
498 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  66.95 
 
 
525 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  69.72 
 
 
537 aa  677    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  73.42 
 
 
563 aa  727    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  64.18 
 
 
511 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  66.6 
 
 
519 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  72.93 
 
 
515 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  70.97 
 
 
505 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  67.27 
 
 
526 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  64.99 
 
 
525 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  74.05 
 
 
558 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  71.25 
 
 
478 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  64.17 
 
 
511 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  67.02 
 
 
506 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  64.57 
 
 
500 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  69.11 
 
 
514 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  64.18 
 
 
511 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  63.05 
 
 
510 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  74.49 
 
 
515 aa  754    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  64.17 
 
 
527 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  62.53 
 
 
517 aa  631  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
544 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  63.5 
 
 
623 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
500 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 
482 aa  490  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.52 
 
 
493 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
477 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
494 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
466 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
494 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
493 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
472 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
503 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
467 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
474 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
482 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
496 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
472 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
474 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
492 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
488 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
488 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
496 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
488 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
497 aa  477  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
475 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
499 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
466 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  49.68 
 
 
475 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
466 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
472 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  49.14 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
468 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
468 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
485 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  51.91 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  52.24 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
465 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
485 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
470 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
474 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
470 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
471 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
471 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
472 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
461 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
473 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  45.77 
 
 
478 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
462 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  48.27 
 
 
482 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
490 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>