16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0085 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0085    100 
 
 		 1051 bp  2083    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0283    99.81 
 
 		 1028 bp  2020    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2352    99.71 
 
 		 1057 bp  2056    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2600    100 
 
 		 1060 bp  2083    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.61 
 
 		 1026 bp  2008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  86.42 
 
 		 1041 bp  73.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40530  Transposase IS116/IS110/IS902  86.42 
 
 		 711 bp  73.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41870  Transposase IS116/IS110/IS902  86.42 
 
 		 711 bp  73.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3836    96.43 
 
 		 677 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 2778 bp  48.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 2760 bp  48.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>