16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5653 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 553 aa  1115    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 553 aa  1115    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  39.1 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  30.04 
 
 		 661 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  29.53 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  35.38 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1830  hypothetical protein  40.65 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3087  hypothetical protein  48.94 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  26.41 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  25.97 
 
 		 612 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  34.43 
 
 		 656 aa  54.3  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  23.36 
 
 		 632 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  34.11 
 
 		 742 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.92 
 
 		 332 aa  47.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.37 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>