16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0833 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1361    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  31.25 
 
 		 742 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  35.26 
 
 		 763 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02490  cytoplasm protein, putative  28.81 
 
 		 851 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  30.16 
 
 		 912 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  28.91 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  28.38 
 
 		 661 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  30.95 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  27.56 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  27.71 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  26.92 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  29.35 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1830  hypothetical protein  34.4 
 
 		 489 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 553 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 553 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>