14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5302 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  69.65 
 
 		 618 aa  767    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1288    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  47.19 
 
 		 612 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  30.84 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 		 472 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  25.99 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  31.2 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02490  cytoplasm protein, putative  22.83 
 
 		 851 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  24.3 
 
 		 912 aa  64.7  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  26.92 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  22.95 
 
 		 763 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  22.96 
 
 		 742 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>