More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1395 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.01 
 
 
3235 aa  898    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  32.27 
 
 
6876 aa  801    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  34.51 
 
 
4186 aa  719    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
5802 aa  794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  98.71 
 
 
4874 aa  8600    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.33 
 
 
4239 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  35.6 
 
 
4588 aa  929    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  100 
 
 
5021 aa  9914    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  29.5 
 
 
5854 aa  910    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  38.42 
 
 
4649 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.13 
 
 
3925 aa  1179    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  37.95 
 
 
5628 aa  1102    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  30.4 
 
 
4036 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  30.71 
 
 
2063 aa  835    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.72 
 
 
2363 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  98.91 
 
 
5023 aa  8863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  97.91 
 
 
3818 aa  6735    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 
7157 aa  1209    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 
4869 aa  635  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  30.29 
 
 
3525 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  33.06 
 
 
2176 aa  617  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  30.5 
 
 
1601 aa  610  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  34.52 
 
 
2273 aa  602  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  38.66 
 
 
2454 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  30.51 
 
 
4429 aa  580  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.86 
 
 
4747 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  30.87 
 
 
1870 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  30.48 
 
 
1870 aa  565  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.85 
 
 
3432 aa  554  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.45 
 
 
3308 aa  552  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  40.88 
 
 
2501 aa  554  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  31.38 
 
 
4183 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  37.79 
 
 
1129 aa  551  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.2 
 
 
2316 aa  545  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  36.47 
 
 
4991 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  36.15 
 
 
4265 aa  540  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  36.15 
 
 
4265 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.15 
 
 
3127 aa  540  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  36.78 
 
 
2183 aa  537  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  35.49 
 
 
3335 aa  533  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.2 
 
 
2581 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  41.32 
 
 
5822 aa  529  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  41.32 
 
 
5778 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  34.36 
 
 
2727 aa  526  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  41.11 
 
 
5993 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  41.13 
 
 
5915 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  38.6 
 
 
3811 aa  515  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 
1393 aa  516  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  37.14 
 
 
7149 aa  517  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  34.73 
 
 
2679 aa  517  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.29 
 
 
3470 aa  513  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  43.17 
 
 
1315 aa  513  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.03 
 
 
8646 aa  511  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  41.15 
 
 
4555 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  41.15 
 
 
4614 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  41.05 
 
 
4539 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  37.87 
 
 
5612 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  44.6 
 
 
1749 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 
3231 aa  490  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.35 
 
 
3291 aa  486  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  31 
 
 
1440 aa  485  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.08 
 
 
6403 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.12 
 
 
2151 aa  481  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  41.49 
 
 
1262 aa  481  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  36.39 
 
 
1153 aa  480  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.66 
 
 
2791 aa  481  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.02 
 
 
3498 aa  480  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  44.44 
 
 
1619 aa  480  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.12 
 
 
2370 aa  479  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.58 
 
 
4196 aa  479  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.48 
 
 
5213 aa  480  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.58 
 
 
5149 aa  481  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  34.23 
 
 
5328 aa  479  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 
2137 aa  477  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.46 
 
 
2867 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  30.85 
 
 
2033 aa  477  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.69 
 
 
4502 aa  476  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  34.74 
 
 
2439 aa  477  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.2 
 
 
3629 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  47.02 
 
 
4048 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.99 
 
 
4489 aa  473  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.46 
 
 
8914 aa  474  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  45.84 
 
 
4212 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.63 
 
 
3432 aa  471  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  36.05 
 
 
2684 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.34 
 
 
4136 aa  470  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  41.92 
 
 
4157 aa  466  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.7 
 
 
3695 aa  468  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 
1578 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.42 
 
 
3639 aa  467  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  35.02 
 
 
1054 aa  468  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  40.2 
 
 
2726 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  40.95 
 
 
2653 aa  466  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.66 
 
 
6889 aa  463  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  35.46 
 
 
1153 aa  465  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.85 
 
 
5926 aa  463  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  30.58 
 
 
4354 aa  465  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  47.83 
 
 
4123 aa  463  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.19 
 
 
3348 aa  464  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  47.67 
 
 
4098 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>