27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1219 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1219  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1291  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0958  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0611  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0333  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2482  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  538  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1348  hypothetical protein  99.63 
 
 
273 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1513  hypothetical protein  90.55 
 
 
270 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175272  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1049  hypothetical protein  57.3 
 
 
254 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  1.46795e-13  normal  0.176851 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5573  hypothetical protein  58.82 
 
 
245 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.75505e-11  hitchhiker  0.00177599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4584  hypothetical protein  59.02 
 
 
253 aa  268  9e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.99252e-10  hitchhiker  7.64364e-05 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4727  hypothetical protein  59.38 
 
 
245 aa  266  3e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.00998e-10  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3640  hypothetical protein  59.38 
 
 
245 aa  266  3e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  4.26312e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3968  hypothetical protein  56.25 
 
 
241 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.95097e-12  normal  0.0223462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4119  hypothetical protein  58.37 
 
 
244 aa  253  2e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.21644e-09  hitchhiker  0.00853024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0814  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  31.07 
 
 
399 aa  55.1  1e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00207544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0412  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  27.37 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0276  3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A reductase  30.59 
 
 
403 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2174  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  22.56 
 
 
395 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0352988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2929  3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A reductase  28.24 
 
 
410 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1649  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase  26.83 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.982475  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2019  3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A reductase  31.76 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.439309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1085  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase  27.18 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0137  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  28.95 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0718  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  24.49 
 
 
418 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0537  3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A reductase  28.05 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0662  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  23.02 
 
 
420 aa  42.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>