17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4727 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3640  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000426312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4727  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200998  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5573  hypothetical protein  97.96 
 
 
245 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175505  hitchhiker  0.00177599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1049  hypothetical protein  89.8 
 
 
254 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000146795  normal  0.176851 
 
 
 
NC_010552  BamMC406_4584  hypothetical protein  88.57 
 
 
253 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000199252  hitchhiker  0.0000764364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4119  hypothetical protein  88.98 
 
 
244 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721644  hitchhiker  0.00853024 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3968  hypothetical protein  77.46 
 
 
241 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395097  normal  0.0223462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0333  hypothetical protein  59.38 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0958  hypothetical protein  59.38 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1219  hypothetical protein  59.38 
 
 
282 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1291  hypothetical protein  59.38 
 
 
282 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132365  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0611  hypothetical protein  59.38 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1348  hypothetical protein  59.38 
 
 
273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2482  hypothetical protein  59.38 
 
 
273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1513  hypothetical protein  57.42 
 
 
270 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0412  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  23.17 
 
 
410 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0814  3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase  27.85 
 
 
399 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00207544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>