298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2651 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  5.99175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  5.99175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0602741  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  1.47856e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.91779e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.1714e-07  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.27912e-07  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.20683e-07  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0034  tRNA-Arg  98.63 
 
 
77 bp  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00579174  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0045  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  1.00318e-05  hitchhiker  0.00586866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0011  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0006  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574401  hitchhiker  3.4907e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0012  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0010  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.79679e-08 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0040  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0061  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.312236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0026  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338474  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0025  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171373  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0010  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.381218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0007  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0084  tRNA-Arg  97.26 
 
 
77 bp  129  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0021  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0033  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  93.1 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  2.06186e-13  hitchhiker  3.90519e-09 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0007  tRNA-Arg  93.1 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218909  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6004  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105111  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  3.74311e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0060  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.864941  normal  0.898441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0009  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.702831  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0021  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  0.330692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0024  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  88.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  88.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  88.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3132t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3133t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3134t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3129t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3135t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3131t  tRNA-Arg  91.38 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.05181e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  6.02904e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  6.13432e-05 
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  92.45 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  6.08145e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  6.08145e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  6.34029e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  92.45 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>