14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0063 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2221  insertion element hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0520619  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0063  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.663763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0880  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0972  hypothetical protein  94.74 
 
 
88 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  80 
 
 
273 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  80 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  76 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  50 
 
 
727 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  76 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  76 
 
 
235 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  76 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  76 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  76 
 
 
235 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  68 
 
 
233 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>