More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4960 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4960  putative insertion sequence transposase protein  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00139484  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  56.04 
 
 
116 aa  111  4e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  53.19 
 
 
115 aa  110  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  54.26 
 
 
115 aa  107  7e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  54.26 
 
 
115 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  54.26 
 
 
115 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  55.32 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  54.26 
 
 
115 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  54.26 
 
 
115 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  52.13 
 
 
115 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  47.22 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  47.87 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  52.13 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  50 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  47.87 
 
 
116 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  48.94 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  48.94 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3136  IS66 family transposase orfB  47.87 
 
 
116 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  48.54 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  54.43 
 
 
128 aa  97.1  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  46.3 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  46.3 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  46.3 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  46.3 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  46.3 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  54.43 
 
 
108 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  54.43 
 
 
115 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  54.43 
 
 
108 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3898  IS66 family transposase orfB  46.81 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  45.37 
 
 
115 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  53.16 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  49.53 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.86413e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4294  IS66 family element, orf2  46.81 
 
 
116 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  47.87 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.97988e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  50.55 
 
 
101 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  3.90412e-13 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  50 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.90251e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  50 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  41.9 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  2.42445e-12 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  46.74 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.39365e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  48.94 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>