30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0408 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  50.45 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  53.12 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  52.48 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  35.38 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  34.36 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  35.38 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  30.96 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  30.28 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  32.24 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  28.77 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  29.7 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  32.29 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  30.05 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  27.64 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  28.78 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  26.24 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  26.56 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  26.56 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  28.91 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  27.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  27.37 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  26.4 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  24.14 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  22.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  24.26 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>