31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4867 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4867  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
362 aa  739  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116369  unclonable  1.50992e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.19 
 
 
510 aa  67.4  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.15 
 
 
493 aa  57  4e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.25 
 
 
192 aa  56.6  7e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
490 aa  54.7  3e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.77 
 
 
431 aa  53.5  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
180 aa  53.5  6e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.22 
 
 
644 aa  52  1e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.61 
 
 
212 aa  52.4  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.73 
 
 
958 aa  52  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.56 
 
 
524 aa  52  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.86 
 
 
302 aa  50.8  4e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.6 
 
 
323 aa  50.4  4e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.37 
 
 
176 aa  50.4  5e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1350  hypothetical protein  31.34 
 
 
225 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.627884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.67 
 
 
1133 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.24 
 
 
1139 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.19 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  5.5982e-05  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 
1343 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.08 
 
 
101 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 
284 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 
284 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.25 
 
 
501 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.4 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2402  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.82 
 
 
466 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.4 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
1181 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.03 
 
 
101 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.69 
 
 
232 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.67 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 
415 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>