33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4253 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4253  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  333  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1534  hypothetical protein  54.49 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  29.27 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1926  ChrB domain-containing protein  29.79 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0096  hypothetical protein  29.01 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0285  ChrB domain protein  28.08 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0965  ChrB domain-containing protein  27.27 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  33.54 
 
 
313 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  32.12 
 
 
309 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4139  ChrB domain-containing protein  29.06 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  32.28 
 
 
313 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  34.53 
 
 
323 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  32.19 
 
 
320 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  33.08 
 
 
325 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  28.74 
 
 
332 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  31.16 
 
 
320 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  28.79 
 
 
312 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1175  ChrB domain protein  24.49 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105237  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  30.08 
 
 
325 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  31.33 
 
 
323 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0491  hypothetical protein  28.37 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  28.89 
 
 
316 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  29.1 
 
 
335 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  29.93 
 
 
320 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  29.93 
 
 
320 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  28.15 
 
 
320 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  28.15 
 
 
320 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  28.47 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1766  hypothetical protein  22.68 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  29.13 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  28.57 
 
 
324 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  36.76 
 
 
320 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  33.87 
 
 
333 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>