More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0031 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_Se16SA  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1554 bp  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SB  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1554 bp  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SC  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1554 bp  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SD  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1554 bp  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SE  16S ribosomal RNA  85.06 
 
 		 1554 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se16SF  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1554 bp  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0019  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0181  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SA  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SB  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SC  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SD  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SE  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SF  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa16SG  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1551 bp  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0005  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1545 bp  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.328307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1612 bp  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1612 bp  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1612 bp  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0005  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1555 bp  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.535884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0168  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0067  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1562 bp  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0070  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1562 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0020  16S ribosomal RNA  85.4 
 
 		 1555 bp  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0017  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1555 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000010305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1784  16S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 1550 bp  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1612 bp  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0067  16S ribosomal RNA  85.18 
 
 		 1545 bp  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0081  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1545 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.621558  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0409  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0070  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1545 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1612 bp  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1612 bp  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1612 bp  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0079  16S ribosomal RNA  83.46 
 
 		 1550 bp  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.940903  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0001  16S ribosomal RNA  98.94 
 
 		 1515 bp  2868    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.792854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1612 bp  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0031  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1514 bp  3001    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0005  16S ribosomal RNA  98.88 
 
 		 1516 bp  2855    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0060  16S ribosomal RNA  99.27 
 
 		 1515 bp  2908    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2609  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2572  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0081  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1562 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0021  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1545 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0017  16S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 1545 bp  694    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00979758  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0552  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2179  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2451  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.892819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2494  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1548 bp  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S2  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1493 bp  624  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S1  16S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 1493 bp  624  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  84.74 
 
 		 1545 bp  624  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 1545 bp  617  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0001  16S ribosomal RNA  84.49 
 
 		 1466 bp  613  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.5792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0026  16S ribosomal RNA  84.49 
 
 		 1466 bp  613  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.018663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0056  16S ribosomal RNA  84.49 
 
 		 1431 bp  613  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.046608  normal  0.0392849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0014  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1431 bp  605  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0157988  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0055  16S ribosomal RNA  81.88 
 
 		 1466 bp  601  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0012  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1475 bp  601  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0070  16S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 1475 bp  601  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1639 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  82.9 
 
 		 1641 bp  527  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1641 bp  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 1522 bp  478  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1517 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3013  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1518 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1518 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1522 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r30  16S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 1517 bp  470  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r07  16S ribosomal RNA  83.24 
 
 		 1522 bp  462  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0039  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1558 bp  428  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000267916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0006  16S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 1558 bp  428  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000369599  normal  0.665449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>