22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0310 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0311  hypothetical protein  46.91 
 
 
180 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  39.35 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  39.35 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  31.1 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  31.1 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.49 
 
 
360 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  29.14 
 
 
347 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  26.67 
 
 
364 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  25.95 
 
 
359 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  26.67 
 
 
364 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  27.7 
 
 
364 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  28.95 
 
 
328 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  25.2 
 
 
600 aa  44.3  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.12 
 
 
699 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  26.14 
 
 
700 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  27.03 
 
 
381 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  24.67 
 
 
328 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  24.67 
 
 
328 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  29.53 
 
 
369 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  24.36 
 
 
644 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  36.67 
 
 
394 aa  40.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>