11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6989 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1391    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  40.42 
 
 		 776 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  34.31 
 
 		 814 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  30 
 
 		 539 aa  164  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  29.69 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  30.19 
 
 		 523 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  36.97 
 
 		 704 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  23.03 
 
 		 603 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  29.54 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  39.1 
 
 		 125 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  25.68 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>