17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2341 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2341  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 678 aa  1241    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.559882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1656  flagellar hook-length control protein  39.42 
 
 		 663 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.410936  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0972  flagellar hook-length control protein  40 
 
 		 439 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2021  hypothetical protein  31.58 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.674854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2985  hypothetical protein  40.68 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0333336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31160  hypothetical protein  42.37 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0211968  normal  0.112875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  29.21 
 
 		 580 aa  48.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 		 430 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  32.56 
 
 		 512 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  23.04 
 
 		 593 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  43.86 
 
 		 503 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  25.22 
 
 		 508 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  42.11 
 
 		 487 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 455 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  42.11 
 
 		 497 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>