21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0068 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  271  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  45.77 
 
 
166 aa  112  2e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  45.3 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  47.41 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  48.42 
 
 
123 aa  81.6  3e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  42.28 
 
 
129 aa  80.5  7e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78675e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  43.44 
 
 
125 aa  77.4  6e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  41.88 
 
 
136 aa  76.3  1e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  41.05 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  44.21 
 
 
177 aa  72.4  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  36.45 
 
 
116 aa  63.2  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14394e-11 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  37.82 
 
 
125 aa  62.4  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  34.62 
 
 
111 aa  47.4  7e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  38.76 
 
 
144 aa  47  8e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  48.19 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2763  hypothetical protein  39.29 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124384  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12130  hypothetical protein  37.33 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.949381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>