25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0356 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  238  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  54.1 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  54.17 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  52.1 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  41.88 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  45.9 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  44.35 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  38.94 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  38.33 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  42.06 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  38.33 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  59.76 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  37.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  37.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  37.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  38.53 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4130  hypothetical protein  46.91 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  37.82 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12130  hypothetical protein  38.89 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.949381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1571  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2859  hypothetical protein  35.06 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1064  integral membrane protein  36.97 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.111624  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2763  hypothetical protein  36.54 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124384  normal  0.930619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>