21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  45.77 
 
 
140 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  45.76 
 
 
124 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  46.61 
 
 
124 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  94.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  46.55 
 
 
129 aa  94.4  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  90.9  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  45.45 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  45.45 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  45.45 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  39.83 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  42.24 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  41.49 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  36.44 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  41.27 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  38.33 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  37.78 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  45.12 
 
 
85 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4130  hypothetical protein  30.91 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2859  hypothetical protein  38.89 
 
 
116 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  31.78 
 
 
111 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>