24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5279 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 144 aa  278  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  60.33 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  57.98 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  56.3 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  40.3 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  40.98 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  45.9 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  40.17 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  42.45 
 
 		 129 aa  84.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  40.87 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  43.36 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  35.2 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  39.73 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4130  hypothetical protein  33.61 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2859  hypothetical protein  33.91 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1064  integral membrane protein  33.88 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.111624  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12130  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.949381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1571  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>