4224 genes were found for organism Yersinia pestis Angola



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpAngola_A0001  CDS  NC_010159  270  710  -  441  flavodoxin  YP_001604646  normal  0.285908  normal  0.657203  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0002  CDS  NC_010159  803  1264  -  462  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  YP_001604647  normal  0.402412  normal  0.678119  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0003  CDS  NC_010159  1434  2426  +  993  asparagine synthetase AsnA  YP_001604648  normal  0.52429  normal  0.646496  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0004  CDS  NC_010159  2525  3991  -  1467  hypothetical protein  YP_001604649  normal  1  normal  0.729255  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0005  CDS  NC_010159  3995  5533  -  1539  regulatory ATPase RavA  YP_001604650  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0006  CDS  NC_010159  5807  7675  +  1869  potassium transport protein Kup  YP_001604651  normal  0.0580063  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0007  CDS  NC_010159  7880  8299  +  420  D-ribose pyranase  YP_001604652  hitchhiker  0.00677295  normal  0.894788  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0008  CDS  NC_010159  8350  9276  +  927  ribokinase  YP_001604653  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0009  CDS  NC_010159  9496  10920  -  1425  major facilitator transporter  YP_001604654  decreased coverage  0.000000216435  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0010    NC_010159  9329  9499  +  171      hitchhiker  0.0000011685  normal  0.998737  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0011  CDS  NC_010159  11000  11689  -  690  GntR family transcriptional regulator  YP_001604655  decreased coverage  0.00000019573  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0012  CDS  NC_010159  12058  12204  -  147  hypothetical protein  YP_001604656  decreased coverage  0.0000000367214  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0013  rRNA  NC_010159  12273  13750  +  1478  16S ribosomal RNA    hitchhiker  0.00000840121  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0014  tRNA  NC_010159  13927  14004  +  78  tRNA-Glu    hitchhiker  0.00000370587  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0016  rRNA  NC_010159  17272  17387  +  116  5S ribosomal RNA    normal  0.0354565  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0017  CDS  NC_010159  17956  19164  +  1209  IS285 transposase  YP_001604658  normal  0.0178633  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0018  CDS  NC_010159  19222  19779  -  558  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  YP_001604659  normal  0.0116592  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0019  CDS  NC_010159  19752  20339  -  588  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  YP_001604660  normal  0.0199788  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0020  CDS  NC_010159  20493  20762  +  270  hypothetical protein  YP_001604661  normal  0.0229124  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0021  CDS  NC_010159  20853  21839  +  987  serine/threonine protein kinase  YP_001604662  hitchhiker  0.00225074  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0022  CDS  NC_010159  21867  22490  +  624  periplasmic protein disulfide isomerase I  YP_001604663  hitchhiker  0.00595683  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0023  CDS  NC_010159  22982  25780  +  2799  DNA polymerase I  YP_001604664  decreased coverage  0.0000103572  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0024  CDS  NC_010159  26188  26838  -  651  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_001604665  hitchhiker  0.0000064968  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0025  CDS  NC_010159  27583  28149  +  567  hypothetical protein  YP_001604666  hitchhiker  0.00022411  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0026  CDS  NC_010159  28332  29705  +  1374  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001604667  normal  0.0394693  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0027  CDS  NC_010159  29759  31171  -  1413  nitrogen regulation protein NR(I)  YP_001604668  normal  0.307133  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0028  CDS  NC_010159  31179  32228  -  1050  nitrogen regulation protein NR(II)  YP_001604669  normal  0.533996  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0029  CDS  NC_010159  32466  32975  -  510  IS1541 transposase  YP_001604670  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0030  CDS  NC_010159  33192  34601  -  1410  glutamine synthetase  YP_001604671  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0031  CDS  NC_010159  34959  35102  +  144  hypothetical protein  YP_001604672  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0032  CDS  NC_010159  35162  36985  +  1824  GTP-binding protein TypA/BipA  YP_001604673  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0033  CDS  NC_010159  37307  37897  +  591  phosphatase  YP_001604674  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0034  CDS  NC_010159  37994  38878  +  885  ribonuclease BN  YP_001604675  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0035  CDS  NC_010159  38885  39322  +  438  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_001604676  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0036  CDS  NC_010159  39396  40871  -  1476  transposase  YP_001604677  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0037  CDS  NC_010159  41141  42064  +  924  acetyltransferase domain-containing protein  YP_001604678  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0038  CDS  NC_010159  42199  43908  -  1710  asmA family protein  YP_001604679  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0039  CDS  NC_010159  44056  45441  -  1386  xanthine permease  YP_001604680  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0040  CDS  NC_010159  45679  46893  +  1215  sodium/glutamate symport carrier protein  YP_001604681  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0041  CDS  NC_010159  47259  49340  -  2082  ATP-dependent DNA helicase RecG  YP_001604682  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0042  CDS  NC_010159  49341  50033  -  693  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  YP_001604683  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0043  CDS  NC_010159  50039  52147  -  2109  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  YP_001604684  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0044  CDS  NC_010159  52167  52442  -  276  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  YP_001604685  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0045  CDS  NC_010159  52497  53120  -  624  guanylate kinase  YP_001604686  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0046  CDS  NC_010159  53548  55224  +  1677  NAD-dependent DNA ligase LigB  YP_001604687  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0047    NC_010159  55237  55860  -  624      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0048  CDS  NC_010159  56263  57126  -  864  hypothetical protein  YP_001604688  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0049  CDS  NC_010159  57253  57969  +  717  ribonuclease PH  YP_001604689  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0050  CDS  NC_010159  58094  58603  +  510  IS1541 transposase  YP_001604690  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0051  CDS  NC_010159  58846  59493  +  648  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001604691  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0052  CDS  NC_010159  59628  60224  -  597  nucleoid occlusion protein  YP_001604692  normal  0.881528  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0053  CDS  NC_010159  60346  60801  -  456  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_001604693  normal  0.342796  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0054  CDS  NC_010159  60782  61996  -  1215  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  YP_001604694  normal  0.0231344  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0055  CDS  NC_010159  62193  62861  +  669  DNA repair protein RadC  YP_001604695  hitchhiker  0.00110117  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0056  CDS  NC_010159  63124  63360  +  237  50S ribosomal protein L28  YP_001604696  hitchhiker  0.000196759  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0057  CDS  NC_010159  63372  63539  +  168  50S ribosomal protein L33  YP_001604697  hitchhiker  0.000161244  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0058  CDS  NC_010159  63622  64431  +  810  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001604698  decreased coverage  0.000000284892  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0059  CDS  NC_010159  64437  64916  -  480  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_001604699  hitchhiker  0.0000113354  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0060  CDS  NC_010159  64913  65695  -  783  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  YP_001604700  hitchhiker  0.000254421  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0061  CDS  NC_010159  65696  66973  -  1278  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase  YP_001604701  hitchhiker  0.00193411  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0062  CDS  NC_010159  67393  68358  -  966  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  YP_001604702  normal  0.0223597  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0063  CDS  NC_010159  68358  69422  -  1065  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  YP_001604703  normal  0.877737  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0064  CDS  NC_010159  69453  70385  -  933  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  YP_001604704  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0065  CDS  NC_010159  70601  71842  +  1242  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001604705  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0066  CDS  NC_010159  71852  72877  +  1026  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_001604706  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0067    NC_010159  73015  73949  -  935      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0068  CDS  NC_010159  73973  75343  -  1371  hypothetical protein  YP_001604707  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0069  CDS  NC_010159  75353  76900  -  1548  phosphoglyceromutase  YP_001604708  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0070  CDS  NC_010159  77297  77731  +  435  rhodanese domain-containing protein  YP_001604709  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0071  CDS  NC_010159  77850  78098  +  249  glutaredoxin 3  YP_001604710  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0072  CDS  NC_010159  78186  78662  +  477  preprotein translocase subunit SecB  YP_001604711  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0073  CDS  NC_010159  78662  79681  +  1020  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001604712  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0074  CDS  NC_010159  79944  80768  +  825  serine acetyltransferase  YP_001604713  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0075  CDS  NC_010159  80891  81379  -  489  RNA methyltransferase  YP_001604714  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0076  CDS  NC_010159  81568  82389  +  822  adaptative response regulatory protein Ada  YP_001604715  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0077  CDS  NC_010159  82471  83493  +  1023  insertion sequence transposase  YP_001604716  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0078  CDS  NC_010159  83493  84272  +  780  transposase/IS protein  YP_001604717  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0079    NC_010159  84352  84591  +  240      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0080  CDS  NC_010159  84640  86016  -  1377  two-component sensor protein  YP_001604718  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0081  CDS  NC_010159  86013  86711  -  699  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  YP_001604719  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0082  CDS  NC_010159  86885  87373  +  489  periplasmic stress adaptor protein CpxP  YP_001604720  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0083  CDS  NC_010159  87830  88006  +  177  hypothetical protein  YP_001604721  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0084  CDS  NC_010159  88051  89010  +  960  hypothetical protein  YP_001604722  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0085    NC_010159  89078  89200  -  123      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0086    NC_010159  89316  89438  -  123      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0087  CDS  NC_010159  89572  90474  +  903  ferrous iron efflux protein F  YP_001604723  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0088  CDS  NC_010159  90692  91675  +  984  6-phosphofructokinase  YP_001604724  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0089  CDS  NC_010159  91896  92885  +  990  sulfate transporter subunit  YP_001604725  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0090  CDS  NC_010159  93135  93953  -  819  hypothetical protein  YP_001604726  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0091  CDS  NC_010159  94029  95456  -  1428  divalent anion:Na+ symporter family protein  YP_001604727  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0092  CDS  NC_010159  95522  96235  -  714  hypothetical protein  YP_001604728  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0093  CDS  NC_010159  96232  96969  -  738  hypothetical protein  YP_001604729  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0094  CDS  NC_010159  97106  98341  +  1236  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  YP_001604730  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0095  CDS  NC_010159  98573  99340  -  768  triosephosphate isomerase  YP_001604731  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0096  CDS  NC_010159  99469  100104  -  636  hypothetical protein  YP_001604732  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0097  CDS  NC_010159  100252  100686  +  435  hypothetical protein  YP_001604733  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0098  CDS  NC_010159  101008  101754  -  747  ferredoxin-NADP reductase  YP_001604734  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0099  CDS  NC_010159  101909  102964  -  1056  fructose 1,6-bisphosphatase II  YP_001604735  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0100  CDS  NC_010159  103156  104679  -  1524  glycerol kinase  YP_001604736  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_A0101  CDS  NC_010159  104856  105704  -  849  glycerol uptake facilitator protein  YP_001604737  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>