18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0067 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 1011 bp  1025    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0067    100 
 
 		 935 bp  1853    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  99.81 
 
 		 1011 bp  1017    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  81.37 
 
 		 957 bp  81.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  89.06 
 
 		 942 bp  71.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  85.94 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 960 bp  56  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  86.44 
 
 		 960 bp  54  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  100 
 
 		 1743 bp  52  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  96.43 
 
 		 960 bp  48.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  85.71 
 
 		 948 bp  48.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  96.43 
 
 		 960 bp  48.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>