5258 genes were found for organism Escherichia coli E24377A



Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcE24377A_0001  CDS  NC_009801  336  2798  2463  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_001461170  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0002  CDS  NC_009801  2800  3732  933  homoserine kinase  YP_001461171  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0003  CDS  NC_009801  3733  5019  1287  threonine synthase  YP_001461172  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0004  CDS  NC_009801  5309  5806  498  hypothetical protein  YP_001461173  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0005  CDS  NC_009801  5789  6769  981  IS621, transposase  YP_001461174  normal  0.854592  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0006  CDS  NC_009801  6961  7737  777  hypothetical protein  YP_001461175  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0007  CDS  NC_009801  7807  9237  1431  amino acid carrier protein  YP_001461176  normal  0.665719  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0008  CDS  NC_009801  9516  10469  954  transaldolase B  YP_001461177  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0009  CDS  NC_009801  10584  11171  588  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_001461178  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0010  CDS  NC_009801  11206  11772  567  hypothetical protein  YP_001461179  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0011  CDS  NC_009801  11921  12634  714  hypothetical protein  YP_001461180  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0012  CDS  NC_009801  12660  13064  405  hypothetical protein  YP_001461181  normal  0.892717  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0013  CDS  NC_009801  13199  13348  150  hypothetical protein  YP_001461182  normal  0.351418  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0014  CDS  NC_009801  13441  15357  1917  molecular chaperone DnaK  YP_001461183  normal  0.720404  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0015  CDS  NC_009801  15446  16576  1131  chaperone protein DnaJ  YP_001461184  normal  0.292346  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0016  CDS  NC_009801  17418  18584  1167  pH-dependent sodium/proton antiporter  YP_001461185  hitchhiker  0.000467126  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0017  CDS  NC_009801  18650  19549  900  transcriptional activator NhaR  YP_001461186  hitchhiker  1.11428e-05  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0018  CDS  NC_009801  19588  20547  960  hypothetical protein  YP_001461187  hitchhiker  9.707e-07  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0019    NC_009801  20560  21567  1008      hitchhiker  3.07086e-06  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0020  CDS  NC_009801  22138  23460  1323  hypothetical protein  YP_001461188  hitchhiker  8.75951e-08  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0021  CDS  NC_009801  23481  23585  105  hypothetical protein  YP_001461189  hitchhiker  2.39765e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0022  CDS  NC_009801  23844  24008  165  hypothetical protein  YP_001461190  hitchhiker  2.58043e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0023  CDS  NC_009801  24030  24293  264  30S ribosomal protein S20  YP_001461191  hitchhiker  2.55802e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0024  CDS  NC_009801  24396  24614  219  hypothetical protein  YP_001461192  decreased coverage  2.53239e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0025  CDS  NC_009801  24622  25563  942  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  YP_001461193  hitchhiker  4.98514e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0026  CDS  NC_009801  25606  28422  2817  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001461194  hitchhiker  2.76203e-05  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0027  CDS  NC_009801  28422  28916  495  lipoprotein signal peptidase  YP_001461195  normal  0.102784  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0028  CDS  NC_009801  29021  29470  450  FKBP-type 16 kDa peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001461196  normal  0.140187  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0029  CDS  NC_009801  29472  30422  951  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_001461197  normal  0.253464  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0030  CDS  NC_009801  30488  31402  915  ribonucleoside hydrolase RihC  YP_001461198  normal  0.719928  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0031  CDS  NC_009801  31569  32390  822  dihydrodipicolinate reductase  YP_001461199  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0032  CDS  NC_009801  32633  32728  96  hypothetical protein  YP_001461200  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0033  CDS  NC_009801  32846  33994  1149  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001461201  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0034  CDS  NC_009801  34012  37233  3222  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001461202  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0035  CDS  NC_009801  37241  37459  219  hypothetical protein  YP_001461203  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0036  CDS  NC_009801  37494  37889  396  DNA-binding transcriptional activator CaiF  YP_001461204  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0037  CDS  NC_009801  37975  38565  591  carnitine operon protein CaiE  YP_001461205  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0038  CDS  NC_009801  38571  39356  786  carnitinyl-CoA dehydratase  YP_001461206  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0039  CDS  NC_009801  39465  41033  1569  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  YP_001461207  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0040  CDS  NC_009801  41092  42309  1218  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  YP_001461208  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0041  CDS  NC_009801  42438  43580  1143  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  YP_001461209  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0042  CDS  NC_009801  43611  45125  1515  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  YP_001461210  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0043  CDS  NC_009801  45140  45241  102  hypothetical protein  YP_001461211  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0044  CDS  NC_009801  45420  45530  111  hypothetical protein  YP_001461212  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0045  CDS  NC_009801  45599  46369  771  putative electron transfer flavoprotein FixA  YP_001461213  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0046  CDS  NC_009801  46384  47325  942  putative electron transfer flavoprotein FixB  YP_001461214  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0047  CDS  NC_009801  47376  48662  1287  putative oxidoreductase FixC  YP_001461215  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0048  CDS  NC_009801  48659  48946  288  ferredoxin homolog FixX  YP_001461216  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0049  CDS  NC_009801  49004  50335  1332  major facilitator family transporter  YP_001461217  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0050  CDS  NC_009801  50443  50973  531  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  YP_001461218  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0051  CDS  NC_009801  50966  52828  1863  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  YP_001461219  normal  0.903961  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0052  CDS  NC_009801  53020  53499  480  dihydrofolate reductase  YP_001461220  normal  0.264396  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0053  CDS  NC_009801  53577  54419  843  diadenosine tetraphosphatase  YP_001461221  normal  0.0296879  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0054  CDS  NC_009801  54426  54803  378  ApaG  YP_001461222  hitchhiker  0.00391573  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0055  CDS  NC_009801  54806  55627  822  dimethyladenosine transferase  YP_001461223  hitchhiker  0.00458871  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0056  CDS  NC_009801  55624  56613  990  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_001461224  hitchhiker  0.00297721  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0057  CDS  NC_009801  56613  57899  1287  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_001461225  hitchhiker  7.04292e-05  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0058  CDS  NC_009801  57952  60306  2355  organic solvent tolerance protein  YP_001461226  unclonable  8.25468e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0059  CDS  NC_009801  60561  61376  816  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_001461227  unclonable  6.13097e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0060  CDS  NC_009801  61493  62152  660  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  YP_001461228  hitchhiker  1.57754e-08  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0061  CDS  NC_009801  62164  65070  2907  ATP-dependent helicase HepA  YP_001461229  hitchhiker  0.000176621  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0062  CDS  NC_009801  65235  67586  2352  DNA polymerase II  YP_001461230  hitchhiker  0.00931565  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0063  CDS  NC_009801  67661  68356  696  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  YP_001461231  normal  0.0142427  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0064  CDS  NC_009801  68525  70027  1503  L-arabinose isomerase  YP_001461232  normal  0.0849875  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0065  CDS  NC_009801  70038  71738  1701  ribulokinase  YP_001461233  normal  0.703841  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0066  CDS  NC_009801  72077  72955  879  DNA-binding transcriptional regulator AraC  YP_001461234  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0067  CDS  NC_009801  73041  73805  765  hypothetical protein  YP_001461235  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0068  CDS  NC_009801  73919  74617  699  thiamine transporter ATP-binding subunit  YP_001461236  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0069  CDS  NC_009801  74601  76211  1611  thiamine transporter membrane protein  YP_001461237  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0070  CDS  NC_009801  76187  77170  984  thiamine transporter substrate binding subunit  YP_001461238  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0071  CDS  NC_009801  77214  77333  120  putative lipoprotein  YP_001461239  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0072  CDS  NC_009801  77334  78989  1656  transcriptional regulator SgrR  YP_001461240  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0073  CDS  NC_009801  79311  80489  1179  major facilitator superfamily sugar transporter  YP_001461241  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0074  CDS  NC_009801  80538  81143  606  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_001461242  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0075  CDS  NC_009801  81154  82554  1401  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_001461243  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0076  CDS  NC_009801  82557  83648  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001461244  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0077  CDS  NC_009801  83648  85219  1572  2-isopropylmalate synthase  YP_001461245  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0078  CDS  NC_009801  86058  87002  945  leucine transcriptional activator  YP_001461246  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0079  CDS  NC_009801  87320  89044  1725  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  YP_001461247  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0080  CDS  NC_009801  89047  89538  492  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  YP_001461248  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0081  CDS  NC_009801  89590  89721  132  hypothetical protein  YP_001461249  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0082  CDS  NC_009801  89718  90722  1005  DNA-binding transcriptional regulator FruR  YP_001461250  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0083  CDS  NC_009801  91324  91782  459  cell division protein MraZ  YP_001461251  normal  0.838151  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0084  CDS  NC_009801  91784  92725  942  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_001461252  normal  0.796275  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0085  CDS  NC_009801  92722  93087  366  cell division protein FtsL  YP_001461253  normal  0.811512  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0086  CDS  NC_009801  93103  94869  1767  peptidoglycan synthetase FtsI  YP_001461254  normal  0.67693  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0087  CDS  NC_009801  94856  96343  1488  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_001461255  normal  0.162607  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0088  CDS  NC_009801  96340  97698  1359  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  YP_001461256  normal  0.134192  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0089  CDS  NC_009801  97692  98774  1083  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_001461257  normal  0.0197057  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0090  CDS  NC_009801  98777  100093  1317  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  YP_001461258  normal  0.0314248  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0091  CDS  NC_009801  100093  101337  1245  cell division protein FtsW  YP_001461259  hitchhiker  0.00890066  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0092  CDS  NC_009801  101334  102401  1068  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_001461260  hitchhiker  0.00165151  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0093  CDS  NC_009801  102455  103930  1476  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_001461261  hitchhiker  0.00127987  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0094  CDS  NC_009801  103923  104843  921  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001461262  hitchhiker  1.01829e-06  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0095  CDS  NC_009801  104845  105675  831  cell division protein FtsQ  YP_001461263  hitchhiker  3.54285e-08  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0096  CDS  NC_009801  105672  106934  1263  cell division protein FtsA  YP_001461264  unclonable  4.50452e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0097  CDS  NC_009801  106995  108146  1152  cell division protein FtsZ  YP_001461265  hitchhiker  6.52178e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0098  CDS  NC_009801  108247  109164  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001461266  unclonable  7.41814e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0099  CDS  NC_009801  109320  109907  588  SecA regulator SecM  YP_001461267  hitchhiker  8.07515e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0100  CDS  NC_009801  109969  112674  2706  preprotein translocase subunit SecA  YP_001461268  hitchhiker  3.73806e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 53    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>