30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Plut_0136  CDS  NC_007512  147927  148466  -  540  hypothetical protein  YP_374069  unclonable  0.000000000033624  normal  0.854848  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0137  CDS  NC_007512  148884  149324  +  441  hypothetical protein  YP_374070  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0175  CDS  NC_007512  183276  183665  +  390  30S ribosomal protein S12  YP_374108  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0176  CDS  NC_007512  183700  184167  +  468  30S ribosomal protein S7  YP_374109  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0177  CDS  NC_007512  184210  186324  +  2115  elongation factor G  YP_374110  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0265  CDS  NC_007512  270991  271233  +  243  chlorosome envelope protein A  YP_374196  unclonable  0.0000000000105111  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0301  CDS  NC_007512  306600  307379  +  780  hypothetical protein  YP_374232  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0302  CDS  NC_007512  307476  308063  +  588  outer surface protein, putative  YP_374233  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0303  CDS  NC_007512  308123  308608  +  486  hypothetical protein  YP_374234  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0304  CDS  NC_007512  308726  309844  +  1119  glycosyl transferase  YP_374235  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0305  CDS  NC_007512  309968  312871  +  2904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_374236  normal  1  unclonable  0.00000133293  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0335  CDS  NC_007512  345144  345887  +  744  hypothetical protein  YP_374266  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0489  CDS  NC_007512  571386  572480  -  1095  hypothetical protein  YP_374420  unclonable  0.000000000975804  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0490  CDS  NC_007512  572732  573238  +  507  NUDIX/MutT family protein  YP_374421  unclonable  0.0000000000225283  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0536  CDS  NC_007512  626676  629318  +  2643  hypothetical protein  YP_374463  unclonable  0.00000422486  normal  0.794266  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0542  CDS  NC_007512  634475  636118  +  1644  chaperonin GroEL  YP_374469  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0561  CDS  NC_007512  656931  658205  -  1275  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_374487  unclonable  0.00000000187541  normal  0.129733  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0676  CDS  NC_007512  781424  795409  +  13986  VCBS  YP_374597  normal  1  unclonable  0.000119465  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0710  CDS  NC_007512  824903  826240  +  1338  Outer membrane protein-like  YP_374631  unclonable  0.00000000572058  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0946  CDS  NC_007512  1068238  1069425  -  1188  NADH-dependent butanol dehydrogenase  YP_374851  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1118  CDS  NC_007512  1272096  1272293  +  198  hypothetical protein  YP_375023  unclonable  0.00000000000356616  normal  0.666231  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1207  CDS  NC_007512  1366218  1366640  +  423  sigma-24 (FecI-like)  YP_375112  unclonable  0.0000000000222936  normal  0.681645  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1208  CDS  NC_007512  1366804  1367823  +  1020  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  YP_375113  unclonable  0.000000000715023  normal  0.460788  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1442  CDS  NC_007512  1624903  1626168  -  1266  hypothetical protein  YP_375344  unclonable  0.0000000040293  normal  0.558429  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1718  CDS  NC_007512  1924273  1925562  -  1290  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  YP_375615  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1758  CDS  NC_007512  1968437  1969039  -  603  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_375655  unclonable  0.0000000000583338  normal  0.326714  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1976  CDS  NC_007512  2200095  2202299  -  2205  photosystem P840 reaction center, large subunit  YP_375861  unclonable  0.000000329009  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_2133  CDS  NC_007512  2363373  2364842  +  1470  chromosomal replication initiation protein  YP_376018  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_R0009  tRNA  NC_007512  826324  826396  +  73  tRNA-Pro    unclonable  0.00000000000618395  normal  1  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_R0047  tRNA  NC_007512  148563  148637  -  75  tRNA-Asn    unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>