15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0114 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0114  putative type IV secretion system protein IcmL/DotI  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5597  hypothetical protein  29.81 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0458091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0515  hypothetical protein  27.22 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0491  hypothetical protein  27.22 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0369  IcmL  27.05 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1813  IcmL protein  27.05 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0096  TraM  21.76 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937912  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0368  IcmL  21.69 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1814  IcmL protein  21.69 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4191  hypothetical protein  27.4 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0051  traM protein  21.03 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0059  traM protein  21.03 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2140  hypothetical protein  29.67 
 
 
613 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0134  hypothetical protein  27.78 
 
 
176 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0119  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>