12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0059 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0059  traM protein  100 
 
 		 225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0051  traM protein  99.56 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0096  TraM  35.24 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0515  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0491  hypothetical protein  27.32 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0369  IcmL  25.39 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1813  IcmL protein  25.39 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0368  IcmL  23.81 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1814  IcmL protein  23.81 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0114  putative type IV secretion system protein IcmL/DotI  21.03 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4191  hypothetical protein  23.44 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3862  hypothetical protein  24.24 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.999935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>