20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1202 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1202  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 
89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1414  VRR-NUC domain protein  58.75 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1097  hypothetical protein  55.7 
 
 
95 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.938002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2849  VRR-NUC domain protein  54.12 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00265682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3056  VRR-NUC domain protein  51.9 
 
 
86 aa  85.9  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0385  phage protein, putative  50.59 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1197  hypothetical protein  50.63 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0621965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1238  hypothetical protein  50.62 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0372  VRR-NUC domain-containing protein  45.12 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1207  VRR-NUC domain-containing protein  45.12 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1270  VRR-NUC domain-containing protein  45.12 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1827  VRR-NUC domain-containing protein  45.12 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0425  hypothetical protein  45.12 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1175  hypothetical protein  45.12 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0397018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1483  hypothetical protein  45.12 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1476  Phage associated protein  44.16 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3407  VRR-NUC domain-containing protein  42.39 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101416  decreased coverage  0.000615359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1074  VRR-NUC domain-containing protein  34.88 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1054  VRR-NUC  34.88 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.629313  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0523  VRR-NUC domain protein  38.37 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>