21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1175 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0425  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1175  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0397018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1483  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1270  VRR-NUC domain-containing protein  95.65 
 
 
92 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1207  VRR-NUC domain-containing protein  95.65 
 
 
92 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1827  VRR-NUC domain-containing protein  95.6 
 
 
91 aa  173  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0372  VRR-NUC domain-containing protein  94.57 
 
 
92 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1202  VRR-NUC domain-containing protein  45.12 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2849  VRR-NUC domain protein  39.53 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00265682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1414  VRR-NUC domain protein  36.05 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3056  VRR-NUC domain protein  38.82 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000260708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1197  hypothetical protein  36.47 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0621965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1097  hypothetical protein  36.47 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.938002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0385  phage protein, putative  37.21 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1476  Phage associated protein  30.59 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1238  hypothetical protein  32.56 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0523  VRR-NUC domain protein  37.23 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3407  VRR-NUC domain-containing protein  36.26 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101416  decreased coverage  0.000615359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1074  VRR-NUC domain-containing protein  36.51 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1054  VRR-NUC  36.51 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.629313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1192  VRR-NUC domain protein  32.26 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.476317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>