20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0523 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0523  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1197  hypothetical protein  34.41 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0621965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1414  VRR-NUC domain protein  34.41 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1476  Phage associated protein  34.78 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3056  VRR-NUC domain protein  38.2 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1827  VRR-NUC domain-containing protein  38.3 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1270  VRR-NUC domain-containing protein  38.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0372  VRR-NUC domain-containing protein  38.3 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1207  VRR-NUC domain-containing protein  38.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1054  VRR-NUC  31.11 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.629313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1074  VRR-NUC domain-containing protein  31.11 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1202  VRR-NUC domain-containing protein  38.37 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1097  hypothetical protein  31.87 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.938002  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1175  hypothetical protein  37.23 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0397018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1483  hypothetical protein  37.23 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0425  hypothetical protein  37.23 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0385  phage protein, putative  32.61 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3407  VRR-NUC domain-containing protein  36.56 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101416  decreased coverage  0.000615359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2849  VRR-NUC domain protein  32.61 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00265682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1238  hypothetical protein  37.84 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000500761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>