18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3407 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3407  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101416  decreased coverage  0.000615359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3056  VRR-NUC domain protein  47.19 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1202  VRR-NUC domain-containing protein  42.39 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2849  VRR-NUC domain protein  42.35 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00265682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1097  hypothetical protein  42.05 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.938002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1414  VRR-NUC domain protein  38.46 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0385  phage protein, putative  41.18 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1238  hypothetical protein  40.7 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1197  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0621965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1476  Phage associated protein  37.65 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0523  VRR-NUC domain protein  36.56 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373159  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0425  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1175  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0397018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1483  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0372  VRR-NUC domain-containing protein  34.07 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1207  VRR-NUC domain-containing protein  34.07 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1270  VRR-NUC domain-containing protein  34.07 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1827  VRR-NUC domain-containing protein  34.07 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>