19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2178 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2178  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2270  hypothetical protein  93 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  42.24 
 
 		 562 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  41.88 
 
 		 562 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  34.21 
 
 		 555 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  61.19 
 
 		 165 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  70 
 
 		 693 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.33 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.67 
 
 		 691 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  35.65 
 
 		 600 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  34.26 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  29.33 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  31.21 
 
 		 539 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  30.34 
 
 		 550 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  36.19 
 
 		 574 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  28.97 
 
 		 573 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  28.97 
 
 		 573 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  28.44 
 
 		 584 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  28.44 
 
 		 584 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>